衔接上季。忍者们离开神秘岛，但妮娅的水系元素突然失去了控制，在寻找问题之时，突然收到来自海底的一个能量波，于是闯入了水下五千英寻的无尽大海神殿，里面生活着许多海怪（莫罗匹恩人），他们被一个叫特里玛的章鱼怪领导着，但是他的儿子卡尔玛却内心邪恶，他决定用两个护身符（风暴护身符和海浪护身符）来唤醒海上巨蟒“沃杰拉”，来造出惊人的破坏力。卡尔玛为了实现计划，害死了他的爸爸并嫁祸忍者，后得到两个护身符，唤醒了沃杰拉，水淹忍者城。忍者城居民的处境十分危险。本多玛击碎卡尔玛的权杖，卡尔玛失去对沃杰拉的控制，被沃杰拉吞食。妮雅为了击败沃杰拉，不顾自身与海洋融为了一体，最终打败了沃杰拉，妮雅将海水带出忍者城，自己也留在了海水中。
演员：水田山葵 大原惠美 嘉数由美 木村昴 关智一 三石琴乃 松本保典 高木涉 荻野志保子 庆长佑香 矢口麻美 远藤绫 钉宫理惠 间宫康弘 下和田裕贵 小野大辅 悠木碧 渡边直美 木村拓哉 神木隆之介
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演员：阿尔迪斯·霍吉 吉米·辛普森 诺兰·诺斯 杰米·格雷·海德 布莱恩·布鲁姆 凯沙·夏普 Simon Templeman Rick D. Wasserman 艾克·阿玛迪 Mara Junot Sunil Malhotra Jason J. Lewis
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